Designschema och lösning av polypeptidpeptidkedja

I. Sammanfattning
Peptider är speciella makromolekyler så att deras sekvenser är ovanliga i sina kemiska och fysiska egenskaper. Vissa peptider är svåra att syntetisera, medan andra är relativt enkla att syntetisera men svåra att rena. The practical problem is that most peptides are slightly soluble in aqueous solutions, so in our purification, the corresponding part of the hydrophobic peptide must be dissolved in non-aqueous solvents, Therefore, these solvents or buffers are likely to be severely inconsistent with the use of biological experimental procedures, so that technicians are strictly prohibited from using the peptide for their own purposes, so that the following are several Aspekter av utformningen av peptider för forskare.

Designschema och lösning av polypeptidpeptidkedja
För det andra rätt val av syntetiska svåra peptider
1. Total längd på nedreglerade sekvenser
Peptider på mindre än 15 rester är lättare att erhålla eftersom storleken på peptiden ökar och renheten på råprodukten minskar. Eftersom den totala längden på peptidkedjan ökar utöver 20 rester är exakt produktmängd ett viktigt problem. I många experiment är det lätt att få oväntade effekter genom att sänka restnumret under 20.
2. Minska antalet hydrofoba rester
Peptider med en stor övervägande av hydrofoba rester, särskilt i regionen 7-12 rester från C-terminalen, orsakar vanligtvis syntetiska svårigheter. Detta ses som en otillräcklig kombination just för att ett B-fold ark erhålls i syntesen. "I sådana fall kan det vara användbart att konvertera mer än två positiva och negativa rester, eller att sätta Gly eller Pro i peptiden för att låsa upp peptidkompositionen."
3. nedreglering av "svåra" rester
"Det finns ett antal Cys, Met, Arg och försök rester som i allmänhet inte lätt syntetiseras." Ser kommer vanligtvis att användas som ett icke -oxidativt alternativ till Cys.
Designschema och lösning av polypeptidpeptidkedja

För det tredje, förbättra rätt val av lösligt i vatten
1. Justera N eller C -terminalen
I förhållande till sura peptider (det vill säga negativt laddade vid pH 7), rekommenderas acetylering (N-terminusacetylering, C-terminus som alltid upprätthåller en fri karboxylgrupp) särskilt för att öka den negativa laddningen. För grundläggande peptider (det vill säga positivt laddad vid pH 7) rekommenderas emellertid aminering (fri aminogrupp vid N-terminalen och aminering vid C-terminalen) särskilt för att öka den positiva laddningen.

2. Kortar eller förlänger sekvensen kraftigt

Några av sekvenserna innehåller ett stort antal hydrofoba aminosyror, såsom TRP, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr och ALA, etc. När dessa hydrofoba rester överstiger 50%är de vanligtvis inte lätta att lösa upp. Det kan vara användbart att förlänga sekvensen för att ytterligare öka de positiva och negativa polerna i peptiden. Det andra alternativet är att nedreglera storleken på peptidkedjan för att öka de positiva och negativa polerna genom att nedreglera de hydrofoba resterna. Ju starkare de positiva och negativa sidorna av peptidkedjan, desto mer troligt är det att reagera med vatten.
3. Sätt i en vattenlöslig rest
För vissa peptidkedjor kan kombinationen av vissa positiva och negativa aminosyror förbättra vattenlösligheten. Vårt företag rekommenderar N-terminalen eller C-terminalen av sura peptider som ska kombineras med Glu-Glu. N eller C-terminalen för den grundläggande peptiden gavs och sedan Lys-Lys. Om den laddade gruppen inte kan placeras, kan sergly-Ser också placeras i N eller C-terminalen. Detta tillvägagångssätt fungerar emellertid inte när sidorna på peptidkedjan inte kan ändras.