Vad är cellpenetrerande peptider?

Cellpenetrerande peptider är små peptider som lätt kan penetrera cellmembranet.Denna klass av molekyler, särskilt CPPs med målsökningsfunktioner, lovar effektiv läkemedelsleverans till målceller.

Därför har forskningen om det en viss biomedicinsk betydelse.I denna studie studerades CPPs med olika transmembrana aktiviteter på sekvensnivå, för att försöka ta reda på faktorerna som påverkar transmembranaktiviteten hos CPPs, sekvensskillnaderna mellan CPPs med olika aktiviteter och NonCPPs, och introducera en metod för att analysera biologiska sekvenser.

CPPs och NonCPPs-sekvenser erhölls från CPPsite-databasen och olika litteraturer, och transmembranpeptider (HCPPs, MCPPs, LCPPs) med hög, medium och låg transmembranaktivitet extraherades från CPPs-sekvenserna för att konstruera datamängder.Baserat på dessa datauppsättningar genomfördes följande studier:

1, Aminosyra- och sekundärstruktursammansättningen av olika aktiva CPP och NonCPP analyserades med ANOVA.Det visade sig att de elektrostatiska och hydrofoba interaktionerna av aminosyror spelade en viktig roll i transmembranaktiviteten hos CPP, och den spiralformade strukturen och den slumpmässiga lindningen påverkade också den transmembrana aktiviteten hos CPP.

2. De fysikaliska och kemiska egenskaperna och längderna för CPP med olika aktiviteter visades på det tvådimensionella planet.Det visade sig att CPPs och NonCPPs med olika aktiviteter kunde klustras under vissa speciella egenskaper, och HCPPs, MCPPs, LCPPs och NonCPPs delades upp i tre kluster, vilket visade deras skillnader;

3. I denna artikel introduceras begreppet fysisk och kemisk tyngdpunkt av biologisk sekvens, och resterna som utgör sekvensen betraktas som partikelpunkter, och sekvensen abstraheras som ett partikelsystem för forskning.Denna metod användes för analys av CPP:er genom att projicera CPP:er med olika aktiviteter på 3D-planet med PCA-metoden, och det visade sig att de flesta CPP:er klustrade ihop och vissa LCPP:er klustrade tillsammans med NonCPPs.

Denna studie har implikationer för utformningen av CPP och förståelse av skillnaderna i sekvenserna av CPP med olika aktiviteter.Dessutom kan analysmetoden för fysiska och kemiska tyngdpunkten av biologiska sekvenser som introduceras i detta dokument också användas för analys av andra biologiska problem.Samtidigt kan de användas som ingångsparametrar för vissa biologiska klassificeringsproblem och spela en roll för mönsterigenkänning.