Cellpenetrerande peptider är små peptider som lätt kan penetrera cellmembranet. Denna klass av molekyler, särskilt CPP med inriktningsfunktioner, lovar för effektiv läkemedelsleverans till målceller.
Därför har forskningen om den viss biomedicinsk betydelse. I denna studie studerades CPP med olika transmembranaktiviteter på sekvensnivån, försökte ta reda på de faktorer som påverkar transmembranaktiviteten för CPP: er, sekvensskillnaderna mellan CPP med olika aktiviteter och icke -CPP: er och introducerar en metod för att analysera biologiska sekvenser.
CPP: er och icke -CPPS -sekvenser erhölls från CPPSite -databasen och olika litteraturer, och transmembranpeptider (HCPP: er, MCPP, LCPP) med hög, medelstor och låg transmembranaktivitet extraherades från CPPS -sekvenser för att konstruera datauppsättningar. Baserat på dessa datauppsättningar genomfördes följande studier:
1 analyserades aminosyran och sekundärstrukturkompositionen för olika aktiva CPP och icke -CPP: er med ANOVA. Det visade sig att de elektrostatiska och hydrofoba interaktioner av aminosyror spelade en viktig roll i transmembranaktiviteten hos CPP: er, och den spiralformade strukturen och slumpmässig spiral påverkade också transmembranaktiviteten hos CPP.
2. De fysiska och kemiska egenskaperna och längderna på CPP med olika aktiviteter visades på det tvådimensionella planet. Det visade sig att CPP: er och icke -CPP med olika aktiviteter kunde grupperas under vissa speciella egenskaper, och HCPP: er, MCPP: er, LCPP: er och icke -CPP: er delades upp i tre kluster, vilket visade deras skillnader;
3. I detta dokument introduceras begreppet fysisk och kemisk centroid av biologisk sekvens, och resterna som komponerar sekvensen betraktas som partikelpunkter, och sekvensen abstraheras som ett partikelsystem för forskning. Denna metod tillämpades på analysen av CPP genom att projicera CPP: er med olika aktiviteter på 3D -planet med PCA -metoden, och det konstaterades att de flesta CPP: er samlade ihop och vissa LCPP: er klusterade tillsammans med icke -CPP.
Denna studie har konsekvenser för utformningen av CPP: er och förstå skillnaderna i sekvenserna av CPP: er med olika aktiviteter. Dessutom kan analysmetoden för fysisk och kemisk centroid av biologiska sekvenser som introducerats i detta dokument också användas för analys av andra biologiska problem. Samtidigt kan de användas som inmatningsparametrar för vissa biologiska klassificeringsproblem och spela en roll i mönsterigenkänning.
Posttid: 2025-07-02