Typer av peptidbibliotek

Alanine Scanning Library
    Ala-skannande peptidbibliotek är en metod för att identifiera effekterna av specifika aminosyror i en sekvens på peptidfunktionen. Vi ersätter sekvensiellt aminosyrorna i sekvensen med Ala; genom Ala-skanningspeptidbiblioteket kan effekten av specifika aminosyror på den övergripande proteinstrukturen, funktionen och andra biologiska aktiviteter identifieras.

Positional Scanning Library (PSL)
    Ett positionsavsökningspeptidbibliotek är ett viktigt verktyg för att optimera peptidsekvenser. Den ersätter systematiskt utvalda regioner eller ställen av en peptid med andra aminosyror och bestämmer de optimala aminosyrorna vid dessa ställen genom peptidaktivitetsanalyser. Denna typ av peptidbibliotek hjälper forskare att identifiera specifika regioner som har speciella effekter eller aktiviteter på specifika positioner.

Överlappande bibliotek

Det överlappande peptidbiblioteket är en vanlig metod för screening av linjära eller kontinuerliga epitoper. Utformningen av peptidbiblioteket bestäms huvudsakligen av två parametrar: peptidlängd och offsetnummer. Eftersom proteinet är trunkerat från N-terminalen till C-terminalen är det möjligt att en föräldralös peptid kan finnas kvar i slutet. För att bibehålla konsekvent längd rekommenderar vi att en eller flera aminosyror flyttas från N-terminalen.

Trunkeringspeptidbibliotek

Trunkeringspeptidbibliotek används för att identifiera de kortaste aminosyrasekvenserna inom en peptidsekvens. Konstruktionen av trunkeringspeptidbibliotek involverar typiskt systematiskt avlägsnande av aminosyror från båda ändarna av den ursprungliga peptidsekvensen. Om vissa viktiga aminosyror är kända, bör dessa aminosyror behållas, och aminosyror avlägsnas sedan en efter en från den andra änden av peptiden för att börja screena.

Random Peptide Library

Slumpmässiga peptidbibliotek är designade via en shotgun-metod för att inkludera de 20 naturliga aminosyrorna, samtidigt som de slumpmässigt ersätter utvalda aminosyrarester.

Förvrängt bibliotek

Utformningen av förvrängda bibliotek är baserad på interna omarrangemang av den ursprungliga peptidaminosyrasekvensen. Det är det peptidbibliotek med den högsta graden av mutation. Avbrutna peptider används ofta som negativa kontroller för att visa att specifika sekvenser är kritiska för proteinfunktion eller aktivitet. Det är också ett slumpmässigt screeningverktyg som används för att identifiera nya mål.